Сыщики какашек: почему исследователи отслеживают коронавирус в сточных водах

Сыщики какашек: почему исследователи отслеживают коронавирус в сточных водах
Сыщики какашек: почему исследователи отслеживают коронавирус в сточных водах
Станция очистки сточных вод
Станция очистки сточных вод

Утешительно предположить, что как только вы смоете унитаз, его содержимое исчезнет из виду, из памяти. Но большинство людей, вероятно, не осознают, что то, что мы смываем, может многое рассказать нам о здоровье нашего сообщества. И этот материал оказался ценным ресурсом для мониторинга пандемии коронавируса в сообществах по всей стране и во всем мире.

Это называется мониторингом сточных вод или эпидемиологией сточных вод, и с начала пандемии все большее число исследователей в США проверяют образцы неочищенных сточных вод на наличие коронавируса. Они обнаружили, что уровни вируса в очистных сооружениях дают раннее предупреждение об уровне положительных тестов на COVID-19 в сообществах, которые они обслуживают.

«Я давно учу всему тому интересному, что можно узнать из туалетов», - говорит Давида С. Смит, доктор философии, доцент кафедры микробиологии Техасского университета A&M в Сан-Антонио. Она должна знать. Она руководит лабораторией Смита, где она и ее команда студентов изучают сравнительную микробную геномику и эволюцию. Она также дочь сантехника, и большую часть своих исследований она посвятила тому огромному количеству информации, которая попадает в туалеты.

О чем наши экскременты говорят исследователям

Наши фекалии состоят в основном из воды, но остальные 25 процентов представляют собой коктейль из непереваренных остатков пищи, жиров, солей, слизи и патогенов человека, таких как бактерии и вирусы. Если вы заражены коронавирусом, который вызывает заражение COVID-19, то он также будет обнаружен в ваших экскрементах.

Вещество, которое смывается в стоки наших туалетов, а также в раковины, ванны и уличные водостоки, путешествует на многие мили по канализационной системе нашего сообщества и собирается вместе с отходами из других домов во все большие и большие канализационные трубы. Эта река коммунальных сточных вод в конечном итоге впадает в местную очистную станцию, где в конечном итоге пастеризуется и удаляется вредный материал.

Регулярный мониторинг проб сточных вод с течением времени позволяет исследователям проводить анализ тенденций. Эти анализы выявили всплески и новые варианты за несколько дней - даже недель - до тестирования COVID-19 с помощью мазков из носа. А поскольку во всех городах и поселках есть свои собственные очистные сооружения, исследователи могут точно определить, где будут всплески и не появится ли новый вариант, вызывающий озабоченность..

Ковид сточных вод
Ковид сточных вод

Чем полезен надзор за сточными водами?

«Представьте, что у вас есть две недели на подготовку к потенциальной вспышке в общежитии, больнице или другом учреждении», - говорит Смит. «Потенциально вы могли бы нацелить свои вмешательства и, возможно, уменьшить воздействие этой вспышки».

Например, сообщества могут активизировать обмен сообщениями, чтобы предупредить общественность о необходимости практиковать ношение масок, социальное дистанцирование и другие меры для ограничения распространения вируса, а также поощрять тестирование и самоизоляцию для тех, у кого положительный результат теста.

Наблюдение также дает исследователям лучшее понимание того, как мутирует вирус и как эти варианты реагируют на вакцины - факторы, которые жизненно важны для обеспечения безопасности населения. «Нам нужно понять вирус, потому что мы не знаем, куда он пойдет дальше», - говорит Смит.

График эпидемиологии сточных вод
График эпидемиологии сточных вод

Мониторинг канализации и наблюдение за тестированием на COVID-19

Должностные лица органов общественного здравоохранения многое узнали о COVID-19, отслеживая количество положительных тестов по округам, штатам, странам и многим другим. Но у тестирования есть свои ограничения.

Для начала требуется, чтобы люди действительно прошли тестирование. Многие делают это, если они подвергаются воздействию вируса, у них развились симптомы или это требуется для их работы. Но не все в сообществе решают пройти тестирование либо потому, что у них нет медицинской страховки, они не имеют доступа к тестам, не проявляют симптомов или просто не хотят проходить тестирование. «Если вы не пройдете тестирование, у нас не будет никаких данных о вас», - говорит Смит.

Однако "все какают", - добавляет она. «Все должны ходить в туалет, поэтому [благодаря анализу сточных вод] у нас есть данные потенциально о каждом человеке в системе».

Конечно, тестирование сточных вод на коронавирус не является обязательным, поэтому не все муниципалитеты проводят тестирование. Но многие участвуют добровольно благодаря грантам и другим источникам финансирования, включая Закон CARES. Несколько муниципалитетов создали свои собственные информационные панели для обмена данными и анализом тенденций.

В сентябре 2020 года Центры по контролю и профилактике заболеваний (CDC) запустили Национальные системы наблюдения за сточными водами (NWSS) для координации и наращивания потенциала страны по отслеживанию SARS-CoV-2 в пробах сточных вод, собранных на водоочистных сооружениях. по всей стране. В рамках этого проекта агентство недавно представило новый трекер данных CDC COVID, в котором все данные по тестированию сточных вод централизованы на одной панели для всеобщего обозрения.

CDC ожидает, что участие в программе будет расширяться по мере того, как департаменты здравоохранения и лаборатории общественного здравоохранения будут наращивать свой потенциал для координации наблюдения за сточными водами. Тем не менее, это все еще развивающаяся область, и есть ограничения. Среди них очистные сооружения не захватывают дома с септическими системами или сообщества, обслуживаемые децентрализованными системами, которые обрабатывают их отходы, такие как больницы или университеты. Тем не менее, многие колледжи и университеты собирают свои собственные данные, в том числе Университет Эмори в Атланте, Университет Майами и Университет Буффало, и это лишь некоторые из них.

И хотя концентрация вируса в пробах сточных вод может показать, насколько затронуто сообщество, он не может сказать точное количество инфицированных. Но наличие всех данных на одной странице - в прямом и переносном смысле - может дать лучшее представление о том, как вирус влияет на нашу страну.«Руководство и рекомендации CDC действительно помогут», - говорит Смит.

биолог готовит пробу сточных вод
биолог готовит пробу сточных вод

Эпидемиология сточных вод не нова

«Сточные воды сейчас очень сексуальны. Это во всех новостях», - говорит Смит. «Но вот в чем дело - люди годами используют наблюдение за сточными водами, чтобы искать такие вещи, как, например, полиомиелит».

Да, верно. Исследователи обнаруживают и отслеживают различные вирусы в сточных водах уже более 50 лет и используют эти данные для разработки ответных мер общественного здравоохранения.

Например, полиомиелит был ликвидирован почти во всех странах благодаря вакцине против полиомиелита. Но передача все еще продолжается в трех странах, где вакцины отстают, - Нигерии, Афганистане и Пакистане. Вместо того, чтобы полагаться на зарегистрированные случаи острого вялого паралича (ОВП), вероятной причины полиомиелита, исследователи искали сточные воды, чтобы обнаружить полиовирус, выделяемый в фекалиях непарализованных людей, инфицированных полиомиелитом.

Наблюдение за сточными водами также использовалось для обнаружения других вирусов, таких как гепатит B и норовирус. Смит говорит, что в настоящее время она работает над совершенствованием методов тестирования, чтобы лучше контролировать очистные сооружения на предмет гриппа - вируса, по ее словам, «очень хорошо вызывает пандемии».

Понимая ценность наших отходов, «вы видите их в совершенно новом свете», - говорит Смит, ссылаясь на комментарий, который недавно сказал ей работодатель местной коммунальной службы: «Это просто сточные воды, если вы их не используете."

Интересно

Обследование канализационных вод нужно не только для наблюдения за вирусами. Он также используется для определения местных уровней незаконных и отпускаемых по рецепту опиоидов, а также опиоидного антидота налоксона в сообществах, наиболее пострадавших от опиоидной эпидемии, в попытке направить ответные меры общественного здравоохранения..